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  A genome-wide SNP genotyping array reveals patterns of global and repeated species-pair divergence in sticklebacks

Jones, F. C., Chan, Y. F., Schmutz, J., Grimwood, J., Brady, S. D., Southwick, A. M., Absher, D. M., Myers, R. M., Reimchen, T. E., Deagle, B. E., Schluter, D., & Kingsley, D. M. (2012). A genome-wide SNP genotyping array reveals patterns of global and repeated species-pair divergence in sticklebacks. Current Biology, 22, 83-90. doi:10.1016/j.cub.2011.11.045.

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基本情報

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資料種別: 学術論文

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Jones_et_al_2012.pdf (出版社版), 2MB
 
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-
ファイル名:
Jones_et_al_2012.pdf
説明:
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閲覧制限:
制限付き (Max Planck Institute for Evolutionary Biology, MPLM; )
MIMEタイプ / チェックサム:
application/pdf
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著作権情報:
-
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Jones, Felicity C., 著者
Chan, Yingguang Frank1, 著者           
Schmutz, Jeremy, 著者
Grimwood, Jane, 著者
Brady, Shannon D., 著者
Southwick, Audrey M., 著者
Absher, Devin M., 著者
Myers, Richard M., 著者
Reimchen, Thomas E., 著者
Deagle, Bruce E., 著者
Schluter, Dolph, 著者
Kingsley, David M., 著者
所属:
1Department Evolutionary Genetics, Max Planck Institute for Evolutionary Biology, Max Planck Society, ou_1445635              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Genes underlying repeated adaptive evolution in natural
populations are still largely unknown. Stickleback fish (Gasterosteus
aculeatus) have undergone a recent dramatic
evolutionary radiation, generating numerous examples of
marine-freshwater species pairs and a small number of
benthic-limnetic species pairs found within single lakes
[1]. We have developed a new genome-wide SNP genotyping
array to study patterns of genetic variation in sticklebacks
over a wide geographic range, and to scan the genome for
regions that contribute to repeated evolution of marinefreshwater
or benthic-limnetic species pairs. Surveying 34
global populations with 1,159 informative markers revealed
substantial genetic variation, with predominant patterns
reflecting demographic history and geographic structure.
After correcting for geographic structure and filtering for
neutral markers, we detected large repeated shifts in allele
frequency at some loci, identifying both known and novel
loci likely contributing to marine-freshwater and benthiclimnetic
divergence. Several novel loci fall close to genes
implicated in epithelial barrier or immune functions, which
have likely changed as sticklebacks adapt to contrasting
environments. Specific alleles differentiating sympatric
benthic-limnetic species pairs are shared in nearby solitary
populations, suggesting an allopatric origin for adaptive
variants and selection pressures unrelated to sympatry in
the initial formation of these classic vertebrate species pairs

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2012-01-10
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): eDoc: 578934
DOI: 10.1016/j.cub.2011.11.045
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Current Biology
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: -
ページ: - 巻号: 22 通巻号: - 開始・終了ページ: 83 - 90 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0960-9822 (print)
ISSN: 1879-0445 (online)