Fill Order: Normal
Compression: LZW
dc:description: Example of extracted ion current chromatograms and tandem mass spectra for detection and localization of a deamidated peptide.A. Extracted ion current chromatograms of the unmodified tryptic peptide SINSATHYAESVK at m/z 703.84 and 469.56 (charges 2+ and 3+, upper panel) and its deamidated form at m/z 704.34 and 469.89 (charges 2+ and 3+, lower panel). Deamidation corresponds to a mass increase of 0.98 Da. The unmodified peptide elutes at 18.4 min. The deamidated species (peak 1 and 2) are eluting at 18.7, and 19.2 min B. y+ fragment ions of the deamidated peptide SINSATHYAESVK and their theoretical masses (m/z) C. MS2 spectrum of the unmodified peptide at m/z 703.84 (charge 2+) and the deamidated peptide at m/z 704.34 (charge 2+). The y+ fragment ions supporting the deamidation of the Asn-Ser motif compared to the unmodified peptide were detected in the LTQ D. Zoom into y fragment ions 10 and 11. The deamidation-induced y10+ shift is indicated by a red arrow.(TIF)
Predictor: 2
tiff:ImageLength: 2250
description: Example of extracted ion current chromatograms and tandem mass spectra for detection and localization of a deamidated peptide.A. Extracted ion current chromatograms of the unmodified tryptic peptide SINSATHYAESVK at m/z 703.84 and 469.56 (charges 2+ and 3+, upper panel) and its deamidated form at m/z 704.34 and 469.89 (charges 2+ and 3+, lower panel). Deamidation corresponds to a mass increase of 0.98 Da. The unmodified peptide elutes at 18.4 min. The deamidated species (peak 1 and 2) are eluting at 18.7, and 19.2 min B. y+ fragment ions of the deamidated peptide SINSATHYAESVK and their theoretical masses (m/z) C. MS2 spectrum of the unmodified peptide at m/z 703.84 (charge 2+) and the deamidated peptide at m/z 704.34 (charge 2+). The y+ fragment ions supporting the deamidation of the Asn-Ser motif compared to the unmodified peptide were detected in the LTQ D. Zoom into y fragment ions 10 and 11. The deamidation-induced y10+ shift is indicated by a red arrow.(TIF)
Page Number: 0 1
Samples Per Pixel: 4 samples/pixel
Strip Offsets: [2250 values]
tiff:ResolutionUnit: Inch
title: Figure S1
X Resolution: 300 dots per inch
Planar Configuration: Chunky (contiguous for each subsampling pixel)
Photometric Interpretation: RGB
File Size: 1274037 bytes
Rows Per Strip: 1 rows/strip
dc:title: Figure S1
File Name: apache-tika-2380745354373702697.tmp
tiff:BitsPerSample: 8
Content-Type: image/tiff
Strip Byte Counts: 180 180 180 180 180 180 180 180 180 197 197 197 268 288 297 286 286 315 311 329 384 382 375 400 397 490 526 536 406 424 389 420 396 401 474 450 462 417 402 435 427 385 356 321 716 602 594 735 641 612 655 636 677 699 656 650 656 649 681 637 584 647 846 730 740 779 562 459 461 484 442 417 407 389 369 402 371 362 278 274 322 305 296 336 324 351 325 330 369 356 385 346 329 336 346 341 300 305 302 309 341 337 319 397 352 386 355 354 354 376 367 364 365 364 346 350 366 375 366 375 344 354 340 335 324 385 374 344 381 417 461 439 389 417 395 351 379 379 402 396 425 424 402 375 352 329 407 415 477 495 539 549 540 581 555 540 551 486 516 535 549 547 475 427 404 424 399 411 429 446 477 522 524 590 566 564 537 570 599 584 581 605 641 576 447 490 471 449 437 509 491 566 562 501 490 556 546 506 515 480 485 605 650 712 750 724 740 790 819 894 900 847 851 806 869 856 978 915 849 794 707 571 634 711 719 727 650 672 680 649 649 622 587 537 575 591 570 509 489 394 471 507 494 515 527 530 595 630 762 755 765 826 904 952 966 944 934 824 800 842 899 886 886 855 827 814 816 745 814 846 839 812 769 752 761 821 816 921 909 905 931 1004 962 1014 927 904 996 1094 1070 1337 1391 1381 1396 1376 1505 1589 1670 1437 1447 1516 1556 1747 1726 1641 1479 1495 1453 1509 1429 1348 1184 1187 1107 1128 1116 1073 1092 1065 1124 1074 1135 1061 1073 1090 1147 1282 1420 1648 1693 1899 2280 2273 3007 3264 3781 3582 3327 1679 337 334 314 261 249 229 213 209 230 243 243 251 251 243 247 245 242 240 240 241 245 233 230 240 243 288 319 326 346 356 412 429 427 394 385 360 371 421 441 421 401 430 310 342 337 295 314 294 340 331 369 380 420 397 439 430 459 359 355 355 669 584 552 719 637 600 571 560 549 640 570 552 580 557 567 574 562 609 674 687 610 640 504 256 290 321 321 319 311 284 292 278 531 455 499 510 472 464 454 454 452 486 510 529 552 546 559 607 551 626 552 357 372 356 384 371 381 342 331 337 327 278 272 272 283 263 260 261 261 279 301 309 285 306 294 284 286 490 427 531 537 557 529 522 507 499 510 539 494 559 549 577 641 550 584 480 341 341 332 364 335 362 342 341 352 339 357 376 381 366 365 347 355 442 416 406 397 396 374 372 379 371 361 376 429 440 430 431 455 447 435 427 416 395 375 365 407 479 475 447 446 467 444 472 419 457 486 476 506 466 460 447 422 390 432 474 476 476 447 434 426 399 424 471 542 519 510 479 494 505 522 474 516 615 635 614 612 624 644 627 605 572 554 616 647 650 664 654 699 644 630 729 697 650 575 582 565 610 640 652 632 655 606 587 514 537 542 561 552 685 669 670 741 819 799 761 754 747 695 752 659 647 687 709 672 650 639 661 577 539 692 740 852 1011 1035 1109 1033 1025 1131 1028 1303 1399 1374 1387 1385 1472 1502 1349 1277 974 1013 1105 1223 1321 1369 1355 1179 1127 1138 1202 1139 1113 1121 1138 1142 1098 1076 1112 1369 1183 1120 982 986 1013 1029 1025 1036 1047 1094 962 1084 1205 1223 1607 1629 2107 2311 2698 4035 4047 2628 1794 273 259 268 260 284 278 259 268 276 274 292 299 397 359 456 447 425 410 400 419 400 400 399 394 431 465 522 545 482 477 395 374 381 371 391 362 355 341 392 395 421 440 374 416 374 399 399 401 421 421 457 497 555 607 601 632 574 511 507 711 742 701 800 841 806 754 716 676 691 639 657 707 645 670 699 687 679 751 806 680 731 709 381 382 387 407 355 354 401 382 351 395 485 489 482 512 462 451 431 680 577 776 799 777 766 639 690 721 722 722 699 634 651 709 787 684 717 440 291 275 300 292 362 401 400 382 405 486 539 576 571 534 591 602 594 691 666 672 632 545 542 600 584 517 479 451 502 470 446 452 477 429 466 364 341 335 329 326 332 335 329 389 381 437 469 445 465 447 481 489 506 541 510 587 607 652 670 632 659 684 566 545 511 521 450 487 506 594 587 469 467 485 435 417 429 439 462 469 479 464 406 412 406 484 524 590 604 574 587 570 571 596 629 571 626 574 601 614 590 536 516 545 556 529 530 616 756 836 845 791 796 819 796 802 735 704 777 805 774 710 705 669 679 726 802 750 737 777 832 854 790 746 837 879 900 921 1556 1831 1722 1976 1382 941 884 841 789 626 729 770 709 680 1088 1234 1279 1366 1340 1123 1208 1231 1228 1392 1381 1288 1178 947 962 1072 924 701 705 679 699 756 840 787 720 787 886 1025 1271 1230 1216 1161 1252 1311 1542 1494 1498 1435 1329 1453 1600 1605 1523 1465 1180 1363 1684 1685 1567 1473 1448 1213 1326 1341 1267 1113 1158 1147 1286 1272 1022 1030 871 993 1092 1123 1035 1092 1182 1187 1437 1517 1737 1864 2038 2541 3070 3778 3865 3736 2505 1157 1024 1131 1128 1107 1107 1090 1101 1083 712 380 364 370 180 180 180 916 1330 1583 1776 1634 1721 1508 1385 1435 1355 1326 1550 1432 1904 1688 1488 879 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 187 197 197 194 194 261 236 269 252 243 241 246 241 245 246 229 239 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 263 372 436 490 454 414 399 400 424 425 412 426 417 499 512 551 472 257 252 240 246 269 350 364 357 359 412 399 354 296 265 511 542 534 606 615 581 566 560 537 519 489 494 510 495 510 532 546 547 600 665 526 564 622 264 317 299 283 283 283 314 335 301 299 295 286 285 434 426 459 477 452 436 386 469 470 492 492 482 490 531 519 505 534 454 491 504 509 476 459 385 369 400 416 371 355 359 366 357 330 334 344 316 300 296 304 314 268 249 252 250 260 264 270 261 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 222 228 228 228 222 222 222 222 222 245 268 274 283 275 285 282 274 275 272 263 268 272 350 430 446 434 389 394 361 390 401 401 394 412 411 437 426 407 356 299 321 321 309 285 276 281 284 269 270 266 260 279 305 304 324 331 306 320 356 277 275 281 286 287 304 374 359 379 347 386 425 401 456 472 507 514 524 535 502 515 580 574 539 541 501 504 470 455 449 362 359 364 372 406 429 476 446 525 566 587 626 741 649 647 657 687 714 671 671 625 627 604 527 425 446 461 481 446 429 435 426 434 492 512 509 454 500 622 686 582 646 666 699 631 585 599 590 594 561 601 602 592 624 582 556 586 484 470 450 446 446 411 412 414 522 551 772 865 825 900 944 914 920 945 925 964 955 980 1014 1074 880 940 834 670 726 704 741 704 657 611 520 547 564 529 527 547 575 556 570 606 635 669 747 897 931 877 869 832 759 256 250 247 252 243 243 233 204 204 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 242 263 291 305 290 276 325 317 312 309 312 327 335 515 511 526 495 426 460 422 411 429 475 481 531 501 531 514 530 470 419 651 651 601 796 784 785 680 659 690 715 602 539 579 551 559 544 564 597 605 585 502 557 502 220 221 233 222 222 222 225 247 239 237 239 237 228 236 228 225 229 246 259 286 311 330 354 337 339 340 327 351 340 375 400 397 452 467 490 454 431 424 434 431 435 432 397 404 406 380 370 380 355 356 411 445 446 381 390 390 439 319 300 309 284 282 299 301 276 257 212 242 245 229 225 225 232 236 295 340 355 369 337 362 375 351 384 382 379 411 419 421 421 372 344 269 330 371 346 312 277 251 336 327 321 321 381 426 396 384 394 416 426 429 444 432 387 425 407 422 371 370 364 405 434 432 396 416 420 416 309 288 309 327 296 297 292 297 305 295 285 292 287 284 307 340 334 342 305 309 312 312 324 311 304 300 299 372 361 329 362 302 292 326 321 362 301 325 332 331 312 336 424 396 381 399 451 475 451 421 397 440 432 424 370 352 446 505 579 566 494 475 475 544 570 620 630 654 662 680 585 580 470 447 459 497 504 501 500 525 484 487 454 457 467 422 419 410 432 409 400 354 357 369 349 309 232 239 238 319 339 400 414 376 369 372 535 715 811 836 820 906 899 880 887 822 746 721 771 786 799 781 580 457 457 457 466 446 459 431 440 416 464 464 546 509 546 589 652 692 835 899 782 671 270 260 259 263 232 220 194 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 241 279 300 321 299 325 307 320 307 320 307 420 407 397 387 459 466 397 399 370 396 382 434 441 465 477 536 485 541 470 484 412 530 724 660 665 731 719 706 594 572 551 550 516 549 560 576 585 584 556 579 644 511 539 596 237 234 232 234 238 234 232 236 216 213 213 216 214 219 219 234 240 238 238 256 279 291 325 344 345 409 394 355 352 381 406 384 404 415 422 437 430 359 350 337 370 347 375 355 349 351 385 382 359 316 342 336 360 340 367 432 425 361 352 350 312 347 342 389 370 345 372 357 374 326 279 278 282 263 243 255 243 249 249 240 255 287 279 291 273 278 292 287 322 317 326 362 381 396 389 464 457 399 357 395 432 401 366 385 410 392 415 375 375 364 415 334 324 319 317 310 361 377 352 337 329 364 390 310 407 432 416 357 365 370 375 399 377 375 352 332 351 364 309 306 210 210 257 252 263 257 278 265 273 274 273 272 265 250 276 272 248 255 219 219 232 232 261 268 361 332 336 302 329 367 359 351 344 365 384 384 377 356 450 489 484 560 611 639 635 659 667 689 679 667 704 715 739 819 766 781 751 696 617 662 634 645 667 631 554 559 542 501 481 454 434 462 461 447 461 462 467 456 470 506 479 517 520 539 524 442 524 549 592 609 590 674 677 695 907 960 1077 1019 992 992 958 963 909 845 864 864 871 876 819 837 584 601 490 491 511 552 487 495 486 510 531 544 490 525 552 666 735 840 845 745 1745 2517 2442 2586 2042 806 800 786 810 807 311 311 306 307 180 180 180 845 1084 1319 1534 1513 1486 1132 1102 1135 1140 1168 1263 1153 1345 1242 1142 770 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 191 197 197 193 194 261 238 269 248 240 240 243 240 243 247 232 238 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 180 bytes
X-Parsed-By: org.apache.tika.parser.DefaultParser
File Modified Date: Mi. Apr. 24 21:25:04 +02:00 2024
tiff:XResolution: 300.0
tiff:SamplesPerPixel: 4
Document Name: /tmp/tmp_718576359724223061pone.0100736.s001.tif
Unknown tag (0x0152): 2
exif:PageCount: 1
Image Height: 2250 pixels
Orientation: Top, left side (Horizontal / normal)
tiff:Orientation: 1
Image Width: 3000 pixels
Resolution Unit: Inch
XMP Value Count: 15
tiff:ImageWidth: 3000
tiff:YResolution: 300.0
Bits Per Sample: 8 8 8 8 bits/component/pixel
Y Resolution: 300 dots per inch