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  A color-shifting near-infrared fluorescent aptamer-fluorophore module for live-cell RNA imaging

Zhang, J., Wang, L., Jäschke, A., & Sunbul, M. (2021). A color-shifting near-infrared fluorescent aptamer-fluorophore module for live-cell RNA imaging. Angewandte Chemie International Edition, 1-8. doi:10.1002/anie.202107250.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0008-F3BD-1 Versions-Permalink: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-0008-F3BE-0
Genre: Zeitschriftenartikel

Dateien

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:
AngewChemIntEd_epub_2021_250.pdf (beliebiger Volltext), 2MB
 
Datei-Permalink:
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AngewChemIntEd_epub_2021_250.pdf
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Eingeschränkt (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
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:
AngewChemIntEd_epub_2021_250_Suppl.pdf (Ergänzendes Material), 6MB
 
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-
Name:
AngewChemIntEd_epub_2021_250_Suppl.pdf
Beschreibung:
-
OA-Status:
Sichtbarkeit:
Eingeschränkt (Max Planck Institute for Medical Research, MHMF; )
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
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-
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Externe Referenzen

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externe Referenz:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/anie.202107250 (beliebiger Volltext)
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https://doi.org/10.1002/anie.202107250 (beliebiger Volltext)
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OA-Status:
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https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1002%2Fanie.202107250&file=anie202107250-s1-Supporting_Information.pdf (Ergänzendes Material)
Beschreibung:
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Urheber

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 Urheber:
Zhang, Jingye, Autor
Wang, Lu1, Autor           
Jäschke, Andres, Autor
Sunbul, Murat, Autor
Affiliations:
1Chemical Biology, Max Planck Institute for Medical Research, Max Planck Society, ou_2364732              

Inhalt

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Schlagwörter: fluorophores • RNA aptamer • RNA imaging • ratiometric imaging • SELEX
 Zusammenfassung: Fluorescent light-up RNA aptamers (FLAPs) have become promising tools for visualizing RNAs in living cells. Specific binding of FLAPs to their non-fluorescent cognate ligands results in a dramatic fluorescence increase, thereby allowing RNA imaging. Here, we present a color-shifting aptamer-fluorophore system, where the free dye is cyan fluorescent and the aptamer-dye complex is near-infrared (NIR) fluorescent. Unlike other reported FLAPs, this system enables ratiometric RNA imaging. To design the color-shifting system, we synthesized a series of environmentally sensitive benzopyrylium-coumarin hybrid fluorophores which exist in equilibrium between a cyan fluorescent spirocyclic form and a NIR fluorescent zwitterionic form. As an RNA tag, we evolved a 38-nucleotide aptamer that selectively binds the zwitterionic forms with nanomolar affinity. We used this system as a light-up RNA marker to image mRNAs in the NIR region and demonstrated its utility in ratiometric analysis of target RNAs expressed at different levels in single cells.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2021-07-26
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: 9
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1002/anie.202107250
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Angewandte Chemie International Edition
  Kurztitel : Angew. Chem., Int. Ed.
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: Weinheim : Wiley-VCH
Seiten: - Band / Heft: - Artikelnummer: - Start- / Endseite: 1 - 8 Identifikator: ISSN: 1433-7851
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1433-7851