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  Modeling RNA loops using sequence homology and geometric constraints

Schudoma, C., May, P., & Walther, D. (2010). Modeling RNA loops using sequence homology and geometric constraints. Bioinformatics, 26(13), 1671-1672. doi:10.1093/bioinformatics/btq236.

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Basisdaten

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Datensatz-Permalink: http://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-2339-A Versions-Permalink: http://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-0014-233A-8
Genre: Zeitschriftenartikel

Dateien

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:
Schudoma-2010-Modeling RNA loops u.pdf (beliebiger Volltext), 98KB
Name:
Schudoma-2010-Modeling RNA loops u.pdf
Beschreibung:
-
Sichtbarkeit:
Öffentlich
MIME-Typ / Prüfsumme:
application/pdf / [MD5]
Technische Metadaten:
Copyright Datum:
-
Copyright Info:
-
Lizenz:
-

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Schudoma, C.1, Autor              
May, P.1, Autor              
Walther, D.1, Autor              
Affiliations:
1BioinformaticsCIG, Infrastructure Groups and Service Units, Max Planck Institute of Molecular Plant Physiology, Max Planck Society, ou_1753303              

Inhalt

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Schlagwörter: database prediction
 Zusammenfassung: RNA loop regions are essential structural elements of RNA molecules influencing both their structural and functional properties. We developed RLooM, a web application for homology-based modeling of RNA loops utilizing template structures extracted from the PDB. RLooM allows the insertion and replacement of loop structures of a desired sequence into an existing RNA structure. Furthermore, a comprehensive database of loops in RNA structures can be accessed through the web interface.

Details

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Sprache(n): eng - Englisch
 Datum: 2010
 Publikationsstatus: Im Druck veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: ISI: ISI:000278967500016
DOI: 10.1093/bioinformatics/btq236
ISSN: 1367-4803
URI: ://000278967500016 http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/26/13/1671.full.pdf
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Bioinformatics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 26 (13) Artikelnummer: - Start- / Endseite: 1671 - 1672 Identifikator: -