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  De novo sequencing of two novel peptides homologous to calcitonin-like peptides, from skin secretion of the Chinese Frog, Odorrana schmackeri

Evaristo, G. P., Pinkse, M. W., Chen, T., Wang, L., Mohammed, S., Heck, A. J., Mathes, I., Lottspeich, F., Shawb, C., Albare, J. P., & Verhaerta, P. D. (2015). De novo sequencing of two novel peptides homologous to calcitonin-like peptides, from skin secretion of the Chinese Frog, Odorrana schmackeri. EuPA Open Proteomics, 8, 157-166. doi:10.1016/j.euprot.2015.07.008.

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資料種別: 学術論文

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1-s2.0-S2212968515300106-main.pdf (全文テキスト(全般)), 4MB
ファイルのパーマリンク:
https://hdl.handle.net/11858/00-001M-0000-002A-21B0-9
ファイル名:
1-s2.0-S2212968515300106-main.pdf
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application/pdf / [MD5]
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-
著作権情報:
open access article
CCライセンス:
-

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作成者

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 作成者:
Evaristo, Geisa P.C., 著者
Pinkse, Martijn W.H., 著者
Chen, Tianbao, 著者
Wang, Lei, 著者
Mohammed, Shabaz, 著者
Heck, Albert J.R., 著者
Mathes, Isabella1, 著者           
Lottspeich, Friedrich1, 著者           
Shawb, Chris, 著者
Albare, Juan Pablo, 著者
Verhaerta, Peter D.E.M., 著者
所属:
1Lottspeich, Friedrich / Protein Analysis, Max Planck Institute of Biochemistry, Max Planck Society, ou_1565158              

内容説明

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キーワード: Calcitonin-like peptides, CGRP-like peptides, Adrenomedullin-like peptides, Frog skin, LC MSn, De novo sequencing
 要旨: An MS/MS based analytical strategy was followed to solve the complete sequence of two new peptides from frog (Odorrana schmackeri) skin secretion. This involved reduction and alkylation with two different alkylating agents followed by high resolution tandem mass spectrometry. De novo sequencing was achieved by complementary CID and ETD fragmentations of full-length peptides and of selected tryptic fragments. Heavy and light isotope dimethyl labeling assisted with annotation of sequence ion series. The identified primary structures are GCD[I/L]STCATHN[I/L]VNE[I/L]NKFDKSKPSSGGVGPESP-NH2 and SCNLSTCATHNLVNELNKFDKSKPSSGGVGPESF-NH2, i.e. two carboxyamidated 34 residue peptides with an aminoterminal intramolecular ring structure formed by a disulfide bridge between Cys2 and Cys7. Edman degradation analysis of the second peptide positively confirmed the exact sequence, resolving I/L discrimi5nations. Both peptide sequences are novel and share homology with calcitonin, calcitonin gene related peptide (CGRP) and adrenomedullin from other vertebrates. Detailed sequence analysis as well as the 34 residue length of both O. schmackeri peptides, suggest they do not fully qualify as either calcitonins (32 residues) or CGRPs (37 amino acids) and may justify their classification in a novel peptide family within the calcitonin gene related peptide superfamily. Smooth muscle contractility assays with synthetic replicas of the S–S linked peptides on rat tail artery, uterus, bladder and ileum did not reveal myotropic activity.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2015-07-06
 出版の状態: オンラインで出版済み
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1016/j.euprot.2015.07.008
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: EuPA Open Proteomics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Amsterdam : Elsevier
ページ: - 巻号: 8 通巻号: - 開始・終了ページ: 157 - 166 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2212-9685