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  Inferring interactions in complex microbial communities from nucleotide sequence data and environmental parameters

Shang, Y., Sikorski, J., Bonkowski, M., Fiore-Donno, A.-M., Kandeler, E., Marhan, S., et al. (2017). Inferring interactions in complex microbial communities from nucleotide sequence data and environmental parameters. PLoS One, 12(3): e0173765. doi:10.1371/journal.pone.0173765.

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Genre: Zeitschriftenartikel

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BGC2608.pdf (Verlagsversion), 2MB
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BGC2608.pdf
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OA-Status:
Gold
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Öffentlich
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application/pdf / [MD5]
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Gold
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Externe Referenzen

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externe Referenz:
http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0173765 (Verlagsversion)
Beschreibung:
OA
OA-Status:
Gold

Urheber

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 Urheber:
Shang, Yu, Autor
Sikorski, Johannes, Autor
Bonkowski, Michael, Autor
Fiore-Donno, Anna-Maria, Autor
Kandeler, Ellen, Autor
Marhan, Sven, Autor
Boeddinghaus, Runa S., Autor
Solly, Emily1, 2, Autor           
Schrumpf, Marion2, 3, Autor           
Schöning, Ingo2, Autor                 
Wubet, Tesfaye, Autor
Buscot, Francois, Autor
Overmann, Joerg, Autor
Affiliations:
1IMPRS International Max Planck Research School for Global Biogeochemical Cycles, Max Planck Institute for Biogeochemistry, Max Planck Society, Hans-Knöll-Str. 10, 07745 Jena, DE, ou_1497757              
2Soil and Ecosystem Processes, Dr. M. Schrumpf, Department Biogeochemical Processes, Prof. S. E. Trumbore, Max Planck Institute for Biogeochemistry, Max Planck Society, Hans-Knöll-Str. 10, 07745 Jena, DE, ou_1497776              
3Soil Processes, Dr. Marion Schrumpf, Department Biogeochemical Integration, Dr. M. Reichstein, Max Planck Institute for Biogeochemistry, Max Planck Society, ou_1938308              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Interactions occur between two or more organisms affecting each other. Interactions are decisive for the ecology of the organisms. Without direct experimental evidence the analysis of interactions is difficult. Correlation analyses that are based on co-occurrences are often used to approximate interaction. Here, we present a new mathematical model to estimate the interaction strengths between taxa, based on changes in their relative abundances across environmental gradients.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2017-02-272017-03-03
 Publikationsstatus: Online veröffentlicht
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: Anderer: BGC2608
DOI: 10.1371/journal.pone.0173765
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: PLoS One
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: San Francisco, CA : Public Library of Science
Seiten: - Band / Heft: 12 (3) Artikelnummer: e0173765 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1932-6203
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/1000000000277850