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  ShinyCortex: Exploring Single-Cell Transcriptome Data From the Developing Human Cortex.

Kageyama, J., Wollny, D., Treutlein, B., & Camp, J. G. (2018). ShinyCortex: Exploring Single-Cell Transcriptome Data From the Developing Human Cortex. Frontiers in neuroscience, 12: 315. doi:10.3389/fnins.2018.00315.

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Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Kageyama, Jorge, Autor
Wollny, Damian, Autor
Treutlein, Barbara1, Autor           
Camp, J Gray, Autor
Affiliations:
1Max Planck Institute for Molecular Cell Biology and Genetics, Max Planck Society, ou_2340692              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: Single-cell mRNA sequencing (scRNA-seq) is a powerful method to identify and classify cell types and reconstruct differentiation trajectories within complex tissues, such as the developing human cortex. scRNA-seq data also enables the discovery of cell type-specific marker genes and genes that regulate developmental transitions. Here we provide a brief overview of how scRNA-seq has been shaping the study of human cortex development, and present ShinyCortex, a resource that brings together data from recent scRNA-seq studies of the developing cortex for further analysis. ShinyCortex is based in R and displays recently published scRNA-seq data from the human and mouse cortex in a comprehensible, dynamic and accessible way, suitable for data exploration by biologists.

Details

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Sprache(n):
 Datum: 2018-01-01
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: -
 Identifikatoren: DOI: 10.3389/fnins.2018.00315
Anderer: cbg-7141
PMID: 29867326
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: Frontiers in neuroscience
  Andere : Front Neurosci
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: -
Seiten: - Band / Heft: 12 Artikelnummer: 315 Start- / Endseite: - Identifikator: -