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  Mining ancient microbiomes using selective enrichment of damaged DNA molecules

Weiß, C., Gansauge, M.-T., Aximu-Petri, A., Meyer, M., & Burbano, H. (2020). Mining ancient microbiomes using selective enrichment of damaged DNA molecules. BMC Genomics, 21(1): 432. doi:10.1186/s12864-020-06820-7.

Item is

Basisdaten

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Genre: Zeitschriftenartikel

Externe Referenzen

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Urheber

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 Urheber:
Weiß, CL1, 2, Autor           
Gansauge, M-T, Autor
Aximu-Petri, A, Autor
Meyer, M, Autor
Burbano, HA1, 2, Autor           
Affiliations:
1Department Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375790              
2Research Group for Ancient Genomics and Evolution, Department Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3406007              

Inhalt

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Schlagwörter: -
 Zusammenfassung: The identification of bona fide microbial taxa in microbiomes derived from ancient and historical samples is complicated by the unavoidable mixture between DNA from ante- and post-mortem microbial colonizers. One possibility to distinguish between these sources of microbial DNA is querying for the presence of age-associated degradation patterns typical of ancient DNA (aDNA). The presence of uracils, resulting from cytosine deamination, has been detected ubiquitously in aDNA retrieved from diverse sources, and used as an authentication criterion. Here, we employ a library preparation method that separates molecules that carry uracils from those that do not for a set of samples that includes Neandertal remains, herbarium specimens and archaeological plant remains.

Details

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Sprache(n): eng - English
 Datum: 2020-06
 Publikationsstatus: Erschienen
 Seiten: -
 Ort, Verlag, Ausgabe: -
 Inhaltsverzeichnis: -
 Art der Begutachtung: Expertenbegutachtung
 Identifikatoren: DOI: 10.1186/s12864-020-06820-7
PMID: 32586278
 Art des Abschluß: -

Veranstaltung

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Entscheidung

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Projektinformation

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Quelle 1

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Titel: BMC Genomics
Genre der Quelle: Zeitschrift
 Urheber:
Affiliations:
Ort, Verlag, Ausgabe: BioMed Central
Seiten: 9 Band / Heft: 21 (1) Artikelnummer: 432 Start- / Endseite: - Identifikator: ISSN: 1471-2164
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/111000136905010