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  rQuant.web: a tool for RNA-Seq-based transcript quantitation

Bohnert, R., & Rätsch, G. (2010). rQuant.web: a tool for RNA-Seq-based transcript quantitation. Nucleic Acids Research (London), 38, W348-W351. doi:10.1093/nar/gkq448.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-58FA-A 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-58FB-9
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Bohnert, R1, 著者           
Rätsch, G1, 著者           
所属:
1Rätsch Group, Friedrich Miescher Laboratory, Max Planck Society, ou_3378052              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: We provide a novel web service, called rQuant.web, allowing convenient access to tools for quantitative analysis of RNA sequencing data. The underlying quantitation technique rQuant is based on quadratic programming and estimates different biases induced by library preparation, sequencing and read mapping. It can tackle multiple transcripts per gene locus and is therefore particularly well suited to quantify alternative transcripts. rQuant.web is available as a tool in a Galaxy installation at http://galaxy.fml.mpg.de. Using rQuant.web is free of charge, it is open to all users, and there is no login requirement.

資料詳細

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言語:
 日付: 2010-07
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1093/nar/gkq448
PMID: 20551130
 学位: -

関連イベント

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: Nucleic Acids Research (London)
  その他 : Nucleic Acids Res
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Oxford : Oxford University Press
ページ: - 巻号: 38 通巻号: - 開始・終了ページ: W348 - W351 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 0305-1048
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/110992357379342