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  Plant genetic archaeology: whole-genome sequencing reveals the pedigree of a classical trisomic line

Salomé, P., & Weigel, D. (2014). Plant genetic archaeology: whole-genome sequencing reveals the pedigree of a classical trisomic line. G3: Genes, Genomes, Genetics, 5(2), 253-259. doi:10.1534/g3.114.015156.

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基本情報

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アイテムのパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-A4E6-9 版のパーマリンク: https://hdl.handle.net/21.11116/0000-000A-A4E7-8
資料種別: 学術論文

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作成者

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 作成者:
Salomé, PA1, 著者           
Weigel, D1, 著者           
所属:
1Department Molecular Biology, Max Planck Institute for Developmental Biology, Max Planck Society, ou_3375790              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: The circadian oscillator is astonishingly robust to changes in the environment but also to genomic changes that alter the copy number of its components through genome duplication, gene duplication, and homeologous gene loss. While studying the potential effect of aneuploidy on the Arabidopsis thaliana circadian clock, we discovered that a line thought to be trisomic for chromosome 3 also bears the gi-1 mutation, resulting in a short period and late flowering. With the help of whole-genome sequencing, we uncovered the unexpected complexity of this trisomic stock's history, as its genome shows evidence of past outcrossing with another A. thaliana accession. Our study indicates that although historical aneuploidy lines exist and are available, it might be safer to generate new individuals and confirm their genomes and karyotypes by sequencing.

資料詳細

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言語:
 日付: 2014-12
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: -
 識別子(DOI, ISBNなど): DOI: 10.1534/g3.114.015156
PMID: 25524155
 学位: -

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訴訟

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Project information

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出版物 1

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出版物名: G3: Genes, Genomes, Genetics
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: Bethesda : Genetics Society of America
ページ: - 巻号: 5 (2) 通巻号: - 開始・終了ページ: 253 - 259 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): ISSN: 2160-1836
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/2160-1836