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  Genome-wide association and meta-analysis of bipolar disorder in individuals of European ancestry

Scott, L. J., Muglia, P., Kong, X. Q., Guan, W., Flickinger, M., Upmanyu, R., Tozzi, F., Li, J. Z., Burmeister, M., Absher, D., Thompson, R. C., Francks, C., Meng, F., Antoniades, A., Southwick, A. M., Schatzberg, A. F., Bunney, W. E., Barchas, J. D., Jones, E. G., Day, R., Matthews, K., McGuffin, P., Strauss, J. S., Kennedy, J. L., Middleton, L., Roses, A. D., Watson, S. J., Vincent, J. B., Myers, R. M., Farmer, A. E., Akil, H., Burns, D. K., & Boehnke, M. (2009). Genome-wide association and meta-analysis of bipolar disorder in individuals of European ancestry. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 106(18), 7501-7506. doi:10.1073/pnas.0813386106.

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資料種別: 学術論文

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Scott_Genome_wide_association_PNAS_2009.pdf (出版社版), 423KB
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作成者

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 作成者:
Scott, Laura J., 著者
Muglia, Pierandrea, 著者
Kong, Xiangyang Q., 著者
Guan, Weihua, 著者
Flickinger, Matthew, 著者
Upmanyu, Ruchi, 著者
Tozzi, Federica, 著者
Li, Jun Z., 著者
Burmeister, Margit, 著者
Absher, Devin, 著者
Thompson, Robert C., 著者
Francks, Clyde1, 著者           
Meng, Fan, 著者
Antoniades, Athos, 著者
Southwick, Audrey M., 著者
Schatzberg, Alan F., 著者
Bunney, William E., 著者
Barchas, Jack D., 著者
Jones, Edward G., 著者
Day, Richard, 著者
Matthews, Keith, 著者McGuffin, Peter, 著者Strauss, John S., 著者Kennedy, James L., 著者Middleton, Lefkos, 著者Roses, Allen D., 著者Watson, Stanley J., 著者Vincent, John B., 著者Myers, Richard M., 著者Farmer, Ann E., 著者Akil, Huda, 著者Burns, Daniel K., 著者Boehnke, Michael, 著者 全て表示
所属:
1Genetics Division, Drug Discovery, GlaxoSmithKline Research and Development, Verona, Italy, ou_persistent22              

内容説明

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キーワード: -
 要旨: Bipolar disorder (BP) is a disabling and often life-threatening disorder that affects approximately 1% of the population worldwide. To identify genetic variants that increase the risk of BP, we genotyped on the Illumina HumanHap550 Beadchip 2,076 bipolar cases and 1,676 controls of European ancestry from the National Institute of Mental Health Human Genetics Initiative Repository, and the Prechter Repository and samples collected in London, Toronto, and Dundee. We imputed SNP genotypes and tested for SNP-BP association in each sample and then performed meta-analysis across samples. The strongest association P value for this 2-study meta-analysis was 2.4 x 10(-6). We next imputed SNP genotypes and tested for SNP-BP association based on the publicly available Affymetrix 500K genotype data from the Wellcome Trust Case Control Consortium for 1,868 BP cases and a reference set of 12,831 individuals. A 3-study meta-analysis of 3,683 nonoverlapping cases and 14,507 extended controls on >2.3 M genotyped and imputed SNPs resulted in 3 chromosomal regions with association P approximately 10(-7): 1p31.1 (no known genes), 3p21 (>25 known genes), and 5q15 (MCTP1). The most strongly associated nonsynonymous SNP rs1042779 (OR = 1.19, P = 1.8 x 10(-7)) is in the ITIH1 gene on chromosome 3, with other strongly associated nonsynonymous SNPs in GNL3, NEK4, and ITIH3. Thus, these chromosomal regions harbor genes implicated in cell cycle, neurogenesis, neuroplasticity, and neurosignaling. In addition, we replicated the reported ANK3 association results for SNP rs10994336 in the nonoverlapping GSK sample (OR = 1.37, P = 0.042). Although these results are promising, analysis of additional samples will be required to confirm that variant(s) in these regions influence BP risk.

資料詳細

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言語: eng - English
 日付: 2009
 出版の状態: 出版
 ページ: -
 出版情報: -
 目次: -
 査読: 査読あり
 識別子(DOI, ISBNなど): PMID: 19416921
DOI: 10.1073/pnas.0813386106
 学位: -

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出版物 1

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出版物名: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  その他 : Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.
種別: 学術雑誌
 著者・編者:
所属:
出版社, 出版地: National Academy of Sciences
ページ: - 巻号: 106 (18) 通巻号: - 開始・終了ページ: 7501 - 7506 識別子(ISBN, ISSN, DOIなど): その他: undefined
その他: 0027-8424
CoNE: https://pure.mpg.de/cone/journals/resource/954925427230